J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire

Créé le 10 décembre 2004

Les taxons bactériens d'intérêt vétérinaire décrits en 2004

Au cours de l'année 2004, 543 nouveaux taxons ou nouvelles combinaisons ont été validement publiés dans International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology et le nombre total des modifications (nouveaux taxons, nouvelles combinaisons, Candidatus, synonymies, amendements, modifications orthographiques...) est de 609 (voir les fichiers Number of published names et Nomenclatural changes validly published in the 2004 issues of the IJSEM in List of Procaryotic Names with Standing in Nomenclature).

Les changements pouvant présenter un intérêt en médecine et/ou en biologie vétérinaires sont présentés dans le tableau ci-dessous.
Les références des publications et les nomenclatures types ne sont pas indiquées, mais elles peuvent être aisément trouvées en consultant List of Procaryotic Names with Standing in Nomenclature.
L'étymologie des noms figure dans le fichier Étymologie des noms des taxons cités dans le "Dictionnaire de bactériologie vétérinaire".

N.B. :
Il n'est pas exclu que des bactéries décrites en 2004, mais non isolées d'une espèce animale et non citées dans ce fichier, puissent coloniser les animaux. Ainsi, le genre Sutterella Wexler et al. 1996 n'avait pas été inclus dans le fichier consacré aux bactéries d'intérêt vétérinaire décrites en 1996 (voir Revue Méd. Vét., 1997, 148, 179-208.) car, à la date du 31 décembre 1996, les souches incluses dans ce genre avaient une origine exclusivement humaine. Toutefois, en septembre 2004, Greetham et al. 2004 décrivent une nouvelle espèce, Sutterella stercoricanis, isolée du chien (voir le fichier ¤ Sutterella ).

Nomenclatures proposées en 2004	Nomenclatures antérieures	Habitat et/ou pouvoir pathogène, commentaires
Aeriscardovia Simpson et al. 2004, gen. nov.		Voir Aeriscardovia aeriphila.
Aeriscardovia aeriphila Simpson et al. 2004, sp. nov.		Aeriscardovia aeriphila pourrait être présente dans l'alimentation des porcs ou pourrait être un hôte normal du caecum des porcs.
Aeromonas molluscorum Miñana-Galbis et al. 2004, sp. nov.		Toutes les souches de Aeromonas molluscorum ont été isolées de mollusques bivalves commercialisés à Barcelone.
Aeromonas simiae Harf-Monteil et al. 2004, sp. nov.		Les deux souches de Aeromonas simiae ont pour origine des fèces de macaques crabiers.
Alteromonadaceae Ivanova and Mikhailov 2001 emend. Ivanova et al. 2004, fam. nov.		La famille des Alteromonadaceae Ivanova and Mikhailov 2001 emend. Ivanova et al. 2004 rassemble les genres Alteromonas et Glaciecola. Glaciecola mesophila a été isolée d'invertébrés marins.
Atopostipes Cotta et al. 2004, gen. nov.		Voir Atopostipes suicloacalis.
Atopostipes suicloacalis corrig. Cotta et al. 2004, sp. nov.	Atopostipes suicloacale (sic) Cotta et al. 2004.	L'habitat de Atopostipes suicloacalis est inconnu, mais on peut supposer que cette bactérie est un micro-organisme de la flore digestive du porc.
Bartonella chomelii Maillard et al. 2004, sp. nov.		Les deux souches de Bartonella chomelii ont été isolées du sang de bovins élevés en France et cliniquement sains.
Bifidobacterium animalis (Mitsuoka 1969) Scardovi and Trovatelli 1974 emend. Masco et al. 2004.	"Bifidobacterium longum subsp. animalis biotype a".	Bifidobacterium animalis est dépourvu de pouvoir pathogène et l'importance de ce taxon est liée à son utilisation en tant que probiotique.
Bifidobacterium animalis subsp. animalis (Mitsuoka 1969) Scardovi and Trovatelli 1974, subsp. nov.		Bifidobacterium animalis subsp. animalis est isolé des fèces de rats, de lapins, de poulets, de veaux et d'eaux usées.
Bifidobacterium animalis subsp. lactis (Meile et al. 1997) Masco et al. 2004, comb. nov.	Bifidobacterium lactis Meile et al. 1997.	Bifidobacterium animalis subsp. lactis est principalement isolé de laits fermentés.
Bifidobacterium psychraerophilum Simpson et al. 2004, sp. nov.	"Bifidobacterium psychroaerophilum" (sic) Simpson et al. 2003.	Bifidobacterium psychraerophilum pourrait avoir pour habitat l'alimentation des porcs ou pourrait être un hôte normal du caecum des porcs.
Borrelia turcica Güner et al. 2004, sp. nov.		Borrelia turcica n'a été isolée que chez des tiques (Hyalomma aegyptium) qui infestent les tortues, les lézards, la perdrix, le lièvre, le hérisson et des petits rongeurs.
Campylobacter insulaenigrae Foster et al. 2004, sp. nov.		Trois souches de Campylobacter insulaenigrae ont pour origine le rectum de phoques capturés en Mer du Nord et une quatrième souche a été isolée du contenu intestinal d'un marsouin retrouvé mort.
"Candidatus Helicobacter heilmannii" O'Rourke et al. 2004.	"Candidatus Helicobacter heilmannii" inclut des souches autrefois désignées sous les nomenclatures de "Gastrospirillum hominis" ou de "Helicobacter heilmannii" type 2.	"Candidatus Helicobacter heilmannii" a été mis en évidence dans la muqueuse gastrique de l'homme et de quelques félidés sauvages (un tigre, un lynx roux et un guépard).
"Candidatus Neoehrlichia mikurensis" Kawahara et al. 2004.		"Candidatus Neoehrlichia mikurensis" a été mis en évidence chez des rats sauvages et chez des tiques vivant au Japon.
Colwelliaceae Ivanova et al. 2004, fam. nov.		La famille des Colwelliaceae comprend les genres Colwellia et Thalassomonas.
Corynebacterium caspium Collins et al. 2004, sp. nov.		L'unique souche de Corynebacterium caspium a été isolée du pénis d'un phoque de la Caspienne.
Enterococcus hermanniensis Koort et al. 2004, sp. nov.		Enterococcus hermanniensis est isolé de viande de poulet et des amygdales de chiens. Son habitat pourrait être l'intestin des poulets et des chiens.
Enterococcus italicus Fortina et al. 2004, sp. nov. Voir Enterococcus		Enterococcus italicus est isolé de fromages artisanaux d'origine italienne.
Enterococcus saccharominimus Vancanneyt et al. 2004, sp. nov. Voir Enterococcus		Enterococcus saccharominimus est isolé du lait et de produits laitiers.
Erysipelotrichaceae Verbarg et al. 2004, fam. nov.		La famille des Erysipelotrichaceae comprend les genres Bulleidia, Erysipelothrix, Holdemania et Solobacterium.
Fusobacterium canifelinum Conrads et al. 2004, sp. nov.		Fusobacterium canifelinum a été isolé de diverses infections chez les carnivores domestiques, mais son habitat normal est certainement la cavité orale puisque cette bactérie est isolée de plaies chez l'homme mordu ou léché par le chien ou le chat.
Hespellia Whitehead et al. 2004, gen. nov.		Les Hespellia sp. ont pour habitat l'intestin des porcs.
Hespellia porcina Whitehead et al. 2004, sp. nov.		Voir Hespellia.
Hespellia stercorisuis Whitehead et al. 2004, sp. nov.		Voir Hespellia.
Jeotgalicoccus pinnipedialis Hoyles et al. 2004, sp. nov.		L'habitat et le pouvoir pathogène de Jeotgalicoccus pinnipedialis sont inconnus. L'unique souche de cette espèce a été isolée d'un écouvillonnage buccal effectué sur un éléphant de mer.
Lactobacillus saerimneri Pedersen and Roos 2004, sp. nov.		Les souches de Lactobacillus saerimneri proviennent des fèces de porcs.
Moritellaceae Ivanova et al. 2004, fam. nov.		La famille des Moritellaceae est réduite à son genre type, le genre Moritella.
Mycoplasma ovis (Neitz et al. 1934) Neimark et al. 2004, comb. nov.	Eperythrozoon ovis Neitz et al. 1934 (Approved Lists 1980).	Mycoplasma ovis a été identifié chez les ovins et les caprins. L'infection est souvent asymptomatique mais elle peut aussi se traduire par des anémies bénignes ou sévères, un ictère, une fièvre et une diminution de la croissance.
Mycoplasma testudineum Brown et al. 2004, sp. nov.		Les sept souches de Mycoplasma testudineum ont été isolées de tortues des déserts nord américains présentant des infections chroniques des voies respiratoires supérieures.
Pseudoalteromonadaceae Ivanova et al. 2004, fam. nov.		La famille des Pseudoalteromonadaceae est constituée des genres Algicola et Pseudoalteromonas.
Salegentibacter holothuriorum Nedashkovskaya et al. 2004, sp. nov.		L'unique souche de Salegentibacter holothuriorum a été isolée d'un concombre de mer.
Shewanellaceae Ivanova et al. 2004, fam. nov.		La famille des Shewanellaceae est réduite à son genre type, le genre Shewanella.
Staphylococcus pulvereri Zakrzewska-Czerwinska et al. 1995 pro synon. Staphylococcus vitulinus corrig. Webster et al. 1994 emend. Svec et al. 2004. Voir Staphylococcus vitulinus		Staphylococcus pulvereri est un synonyme ultérieur et hétérotypique de Staphylococcus vitulinus.
Staphylococcus vitulinus corrig. Webster et al. 1994 emend. Svec et al. 2004. Voir Staphylococcus vitulinus	Staphylococcus vitulus (sic) Webster et al. 1994.	Les souches de Staphylococcus vitulinus ont pour origine l'homme, divers mammifères et des denrées alimentaires d'origine animale. Le pouvoir pathogène de cette espèce est peu documenté.
Streptococcus devriesei Collins et al. 2004, sp. nov.		Streptococcus devriesei a été décrit sur la base de quatre souches bactériennes isolées chez le cheval , en association avec d'autres bactéries, de caries (trois souches) ou de la gencive (une souche).
Streptococcus equi subsp. ruminatorum Fernandez et al. 2004, subsp. nov.		Les six souches de Streptococcus equi subsp. ruminatorum ont été isolées, en culture pure, du lait de petits ruminants atteints de mammites.
Streptococcus halichoeri Lawson et al. 2004, sp. nov.		Streptococcus halichoeri a été isolé de phoques gris. Lawson et al. ne donnent aucune indication en ce qui concerne les lésions observées chez les animaux morts ou les éventuels signes cliniques observés chez les animaux vivants.
Streptococcus minor Vancanneyt et al. 2004, sp. nov.		Deux souches de Streptococcus minor ont pour origine les amygdales de chiens, deux souches proviennent du contenu intestinal de chiens, trois souches ont été isolées d'écouvillonnages anaux effectués sur des chiens sains et les deux autres souches ont été isolées des amygdales d'un chat et d'un veau.
Sutterella stercoricanis Greetham et al. 2004, sp. nov.		L'unique souche de Sutterella stercoricanis a été isolée des fèces d'un Labrador cliniquement sain.
Vagococcus carniphilus Shewmaker et al. 2004, sp. nov. Voir Vagococcus		Les neuf souches de Vagococcus carniphilus, étudiées par Shewmaker et al., provenaient de viande de bœuf.
Vibrio crassostreae Faury et al. 2004, sp. nov.		Les souches de Vibrio crassostreae ont été isolées d'huîtres malades âgées d'au moins 18 mois.
Vibrio gallicus Sawabe et al. 2004, sp. nov.		Les souches de Vibrio gallicus ont été isolées de l'intestin d'ormeaux (Haliotis tuberculata) collectés au large des côtes de le Bretagne.
Vibrio hispanicus Gomez-Gil et al. 2004, sp. nov.	"Vibrio sp. FAFLP group A16".	Vibrio hispanicus a été isolé de l'eau de mer et d'Artemia sp.
Volucribacter Christensen et al. 2004, gen. nov.	"Taxon 33 de Bisgaard".	À l'exception d'une souche isolée chez un poulet, toutes les souches de Volucribacter sp. ont pour origine des psittacidés. Les animaux infectés présentent des septicémies ou des pneumonies ou des infections des voies respiratoires supérieures ou des ophtalmies ou des inflammations purulentes.
Volucribacter amazonae Christensen et al. 2004, sp. nov.	"Volucribacter sp. souches du biovar 2".	Voir Volucribacter.
Volucribacter psittacicida Christensen et al. 2004, sp. nov.	"Volucribacter sp. souches du biovar 1".	Voir Volucribacter.

Note : Les nomenclatures écrites entre guillemets ne sont pas validement publiées.

Abréviations :
comb. nov. : combinatio nova (nouvelle combinaison)
corrig. : corrigendum (devant être corrigé)
emend. : emendavit (il ou elle a amendé)
fam. nov. : familia nova (nouvelle famille)
gen. nov. : genus novum (nouveau genre)
pro synon. : pro synonymon (pour ou comme synonyme)
sp. nov. : species nova (nouvelle espèce)
subsp. nov. : subspecies nova (nouvelle sous-espèce)

Pour de plus amples informations voir le fichier Glossaire de nomenclature bactérienne.

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