J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire

Créé le 08 novembre 2005
Dernière mise à jour le 10 février 2010

AEROMONADALES, AEROMONADACEAE

Ordre des Aeromonadales

L'ordre des Aeromonadales a été proposé dans la deuxième édition du "Bergey's Manual of Systematic Bacteriology" et cette nomenclature a été validement publiée le 07 novembre 2005 par inscription sur la liste de validation 106.

L'ordre des Aeromonadales Martin-Carnahan et Joseph 2005 est défini de la manière suivante : taxon qui rassemble des bacilles droits à Gram négatif, aéro-anaérobies, très généralement oxydase positive, catalase positive, mobiles grâce à un unique flagelle polaire ou immobiles, mésophiles ou psychrophiles, ayant pour habitat l'eau douce ou l'eau de mer (notamment l'eau des estuaires), souvent associés à des espèces animales aquatiques, pouvant être pathogènes pour l'homme, pour des vertébrés endothermes ou ectothermes et pour des invertébrés.
L'ordre des Aeromonadales est placé dans la classe des ¤ Gammaproteobacteria (phylum ou division des ¤ "Proteobacteria", domaine ou empire des "Bacteria" ou des "Eubacteria").

Il existe plusieurs problèmes avec l'ordre des Aeromonadales.

1) Pour Martin-Carnahan et Joseph 2005, l'ordre des Aeromonadales renferme une unique famille, la famille des Aeromonadaceae. La famille des Aeromonadaceae est divisée en trois genres : Aeromonas, Oceanimonas et un genre incertae sedis, le genre Tolumonas. Même si on exclut le genre Tolumonas de cette famille, la définition de l'ordre des Aeromonadales Martin-Carnahan et Joseph 2005 est incorrecte car les Oceanimonas spp. sont mobiles grâce à plusieurs flagelles polaires et elles sont aérobies.
Pour sa part, Tolumonas auensis (unique espèce du genre) est une espèce immobile, aéro-anaérobie, catalase positive en aérobiose, mais catalase négative en anaérobiose.

2) Sur la base de l'étude des séquences des ARNr 16S, le comité éditorial du "Bergey's Manual" place également dans l'ordre des Aeromonadales la famille des ¤ Succinivibrionaceae (famille incertae sedis). Si un bactériologiste accepte que cette famille soit classée dans l'ordre des Aeromonadales, alors la définition de l'ordre des Aeromonadales, telle qu'elle est donnée par Martin-Carnahan et Joseph, doit être profondément modifiée. En effet, les représentants de la famille des ¤ Succinivibrionaceae sont des bacilles à Gram négatif, droits ou incurvés ou de forme hélicoïdale, anaérobies et catalase négative.

Famille des Aeromonadaceae

La famille des Aeromonadaceae a été décrite et validement publiée par Colwell et al. en 1986. En se basant sur l'étude de la séquence des ARNr 5S, sur les catalogues d'oligonucléotides des ARNr 16S, sur les résultats des hybridations ADN-ARNr et sur les résultats des hybridations ADN-ADN, ces auteurs montrent que le genre Aeromonas (alors classé dans la famille des Vibrionaceae) forme un groupe homogène phylogénétiquement distant des Vibrionaceae et des ¤ Enterobacteriaceae.
Pour Colwell et al., la famille des Aeromonadaceae est restreinte au genre Aeromonas et elle est constituée de bacilles droits ou incurvés, mobiles grâce à une ciliature polaire ou immobiles, non sporulés, chimio-organotrophes, aéro-anaérobies, possédant un métabolisme respiratoire et fermentatif, utilisant l'oxygène comme accepteur d'électrons, réduisant les nitrates en nitrites, ne réduisant pas les nitrites en azote, généralement oxydase positive, généralement capables d'utiliser le glucose comme unique source de carbone et d'énergie, généralement capables d'utiliser les sels d'ammonium comme unique source d'azote, psychrophiles ou mésophiles, ayant pour habitat l'eau douce et les eaux usées, souvent associés à des animaux aquatiques, pouvant être pathogènes pour l'homme, les poissons, les grenouilles et d'autres espèces animales.

Dans la deuxième édition du "Bergey's Manual of Systematic Bacteriology", le chapitre consacré à la famille des Aeromonadaceae a été écrit par Martin-Carnahan et Joseph.
La définition de la famille, donnée par ces auteurs, est similaire à celle donnée par Colwell et al. Toutefois, Martin-Carnahan et Joseph précisent que les cellules peuvent se présenter de manière isolée ou groupées par deux ou en courtes chaînes, que le test catalase est positif, que le test oxydase est positif sauf pour Tolumonas auensis, que les espèces du genre Oceanimonas sont halophiles (ce qui n'est actuellement plus vrai puisque Oceanimonas smirnovii, espèce décrite en 2005, n'est pas une espèce halophile obligatoire) et que l'habitat comprend également l'eau de mer.

Comme nous l'avons noté pour l'ordre des Aeromonadales, il existe quelques problèmes avec la définition des Aeromonadaceae telle qu'elle est donnée par Martin-Carnahan et Joseph. En effet, les Oceanimonas spp. sont aérobies et ont un métabolisme strictement respiratoire et Tolumonas auensis est une espèce immobile et catalase négative après culture en anaérobiose.
Il est probable que pour Martin-Carnahan et Joseph la famille des Aeromonadaceae devrait être restreinte au genre Aeromonas. L'inclusion du genre Oceanimonas et peut-être du genre Tolumonas (genre incertae sedis) a conduit ces auteurs à faire quelques ajouts dans la définition, mais ils n'ont pas tenu compte de tous les caractères des genres Oceanimonas et Tolumonas.

Les genres Oceanimonas et Tolumonas n'ont pas d'intérêt en médecine vétérinaire.
. Le genre Oceanimonas a été proposé par Brown et al. en 2001 pour reclasser Pseudomonas doudoroffii. Ces auteurs incluent également dans ce genre une nouvelle espèce, Oceanimonas baumannii. En 2005, une troisième espèce, Oceanimonas smirnovii, sera validement publiée. Les Oceanimonas spp. sont des germes isolés de l'eau de mer.
. Tolumonas auensis a pour habitat l'eau douce et les sédiments des lacs et des rivières.

Le genre Aeromonas comprend plus de 30 espèces ou sous-espèces (voir Aeromonas in List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature) et il est d'une importance majeure en médecine vétérinaire. Il existe de nombreux problèmes taxonomiques * dans le genre Aeromonas et de nouvelles espèces devraient être décrites dans les prochaines années. Aussi, l'auteur de ce dictionnaire ne souhaite pas se lancer dans la rédaction d'un fichier consacré à ce genre. Toutefois, quelques notions sur ces bactéries sont données dans les fichiers ¤ Aeromonas aquariorum, ¤ Aeromonas bivalvium, ¤ Aeromonas culicicola (selon Huys et al. 2005, Aeromonas culicicola est un synonyme ultérieur et hétérotypique de Aeromonas veronii), ¤ Aeromonas hydrophila, ¤ Aeromonas jandaei, ¤ Aeromonas molluscorum, ¤ Aeromonas piscicola, ¤ Aeromonas salmonicida subsp. pectinolytica et ¤ Aeromonas simiae.

Orientation bibliographique

BROWN (G.R.), SUTCLIFFE (I.C.) et CUMMINGS (S.P.) : Reclassification of [Pseudomonas] doudoroffii (Baumann et al. 1983) into the genus Oceanomonas gen. nov. as Oceanomonas doudoroffii comb. nov., and description of a phenol-degrading bacterium from estuarine water as Oceanomonas baumannii sp. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2001, 51, 67-72.

COLWELL (R.R.), MACDONELL (M.T.) et DE LEY (J.) : Proposal to recognize the family Aeromonadaceae fam. nov. Int. J. Syst. Bacteriol., 1986, 36, 473-477.

FISCHER-ROMERO (C.), TINDALL (B.J.) et JÜTTNER (F.) : Tolumonas auensis gen. nov., sp. nov., a toluene-producing bacterium from anoxic sediments of a freshwater lake. Int. J. Syst. Bacteriol., 1996, 46, 183-188.

FISCHER-ROMERO (C.) et TINDALL (B.J.) : Genus incertae sedis III. Tolumonas Fischer-Romero, Tindall and Jüttner 1996, 187^VP. In : D.J. BRENNER, N.R. KRIEG, J.T. STALEY and G. M. GARRITY (eds), Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology, second edition, vol. 2 (The Proteobacteria), part B (The Gammaproteobacteria), Springer, New York, 2005, pp. 578-579.

IVANOVA (E.P.), ONYSHCHENKO (O.M.), CHRISTEN (R.), ZHUKOVA (N.V.), LYSENKO (A.M.), SHEVCHENKO (L.S.), BULJAN (V.), HAMBLY (B.) et KIPRIANOVA (E.A.) : Oceanimonas smirnovii sp. nov., a novel organism isolated from the Black Sea. Syst. Appl. Microbiol., 2005, 28, 131-136.

MARTIN-CARNAHAN (A.) et JOSEPH (S.W.) : Order XII. Aeromonadales ord. nov. In : D.J. BRENNER, N.R. KRIEG, J.T. STALEY and G. M. GARRITY (eds), Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology, second edition, vol. 2 (The Proteobacteria), part B (The Gammaproteobacteria), Springer, New York, 2005, p. 556.

MARTIN-CARNAHAN (A.) et JOSEPH (S.W.) : Family I. Aeromonadaceae Colwell, MacDonell and De Ley 1986, 474^VP. In : D.J. BRENNER, N.R. KRIEG, J.T. STALEY and G. M. GARRITY (eds), Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology, second edition, vol. 2 (The Proteobacteria), part B (The Gammaproteobacteria), Springer, New York, 2005, p. 556.

MARTIN-CARNAHAN (A.) et JOSEPH (S.W.) : Genus I. Aeromonas Stanier 1943, 213^AL. In : D.J. BRENNER, N.R. KRIEG, J.T. STALEY and G. M. GARRITY (eds), Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology, second edition, vol. 2 (The Proteobacteria), part B (The Gammaproteobacteria), Springer, New York, 2005, pp. 557-578.

THE EDITORIAL BOARD : Genus II. Oceanimonas Brown, Sutcliffe and Cummings 2001, 71^VP. In : D.J. BRENNER, N.R. KRIEG, J.T. STALEY and G. M. GARRITY (eds), Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology, second edition, vol. 2 (The Proteobacteria), part B (The Gammaproteobacteria), Springer, New York, 2005, pp. 578-579.

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* : Problèmes taxonomiques au sein du genre Aeromonas

Pour de plus amples informations voir le fichier Aeromonas in List of Procaryotic Names with Standing in Nomenclature et/ou les publications citées ci-dessous.

BEAZ-HIDALGO (R.), ALPERI (A.), FIGUERAS (M.J.) et ROMALDE (J.L.) : Aeromonas piscicola sp. nov., isolated from diseased fish. Syst. Appl. Microbiol., 2009, 32, 471-479.

FIGUERAS (M.J.), SOLER (L.), CHACÓN (M.R.), GUARRO (J.) et MARTÍNEZ-MURCIA (A.J.) : Extended method for discrimination of Aeromonas spp. by 16S rDNA RFLP analysis. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2000, 50, 2069-2073.

LAGANOWSKA (M.) et KAZNOWSKI (A.) : Polymorphism of Aeromonas spp. tRNA intergenic spacers. Syst. Appl. Microbiol., 2005, 28, 222-229.

SAAVEDRA (M.J.), FIGUERAS (M.J.) et. MARTÍNEZ-MURCIA (A.J.) : Updated phylogeny of the genus Aeromonas. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2006, 56, 2481-2487.

SOLER (L.), YÁÑEZ (M.A.), CHACON (M.R.), AGUILERA-ARREOLA (M.G.), CATALÁN (V.), FIGUERAS (M.J.) et. MARTÍNEZ-MURCIA (A.J.) : Phylogenetic analysis of the genus Aeromonas based on two housekeeping genes. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2004, 54, 1511-1519.

YÁÑEZ (M.A.), CATALÁN (V.), APRÁIZ (D.), FIGUERAS (M.J.) et MARTÍNEZ-MURCIA (A.J.) : Phylogenetic analysis of members of the genus Aeromonas based on gyrB gene sequences. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2003, 53, 875-883.

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