J.P. Euzéby : Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire

Créé le 29 janvier 2001

ACTINOMYCES MARIMAMMALIUM

Systématique

La Mer du Nord est sujette à des pollutions pouvant menacer la survie de certaines espèces et un programme de surveillance international de l'écosystème a été mis en place. L’état de santé des mammifères marins peut, partiellement, refléter l’impact des activités humaines sur l’environnement et les animaux morts ou malades font l'objet d'examens complémentaires afin de déterminer l'origine des affections ou des infections.

En 1999, trois souches bactériennes ressemblant à des Actinomyces sp. ont été isolées de deux phoques et d'un marsouin de la Mer du Nord. Ces trois souches ont fait l'objet d'une étude phénotypique et génotypiques afin de préciser leur position taxonomique.
L'étude des acides gras à longues chaînes, réalisée sur la souche CCUG 41710 (souche type de la nouvelle espèce Actinomyces marimammalium), révèle une composition similaire à celle des autres espèces du genre Actinomyces. L'analyse électrophorétique des protéines cellulaires montre que les trois souches, qualifiées de Actinomyces-like, constituent un groupe distinct au sein du genre Actinomyces et l'étude de la séquence de l'ADNr 16S confirme cette position. L'espèce phylogénétiquement la plus proche est ¤ Actinomyces hordeovulneris dont la séquence de l'ARNr 16S présente environ 93 p. cent d'homologie avec celles des souches isolées des mammifères marins.
Aucune étude d'homologie ADN - ADN n'a été réalisée et la détermination de la séquence des ARNr 16S ne permet pas une définition précise de l'espèce bactérienne. Toutefois, selon Stackebrandt et Goebel, lorsque les séquences des ARNr 16S de deux souches bactériennes présentent moins de 97 p. cent d'homologie elles constituent deux espèces différentes. Les caractères phénotypiques permettent une identification des trois souches de Actinomyces-like et Hoyles et al. proposent de les placer dans une nouvelle espèce, Actinomyces marimammalium.

Caractères bactériologiques

Les souches de Actinomyces marimammalium rassemblent des bacilles à Gram positif, droits ou légèrement incurvés, présentant parfois des ébauches de ramification, non acido-résistants, non sporulés, immobiles, aéro-anaérobies, catalase négative.

Les caractères biochimiques ont été étudiés à l'aide de galeries API CORYNE et de galeries API rapid ID32 Strep.
. Une réponse positive est notée pour les tests alanine phénylalanine proline arylamidase, bêta-galactosidase, bêta-galacturonidase, leucine arylamidase, glycyl tryptophane arylamidase, acidification de la N-acétyl-bêta-glucosamine, du glucose, du lactose et du maltose.
. Une réponse négative est obtenue avec les tests nitrate réductase, arginine dihydrolase, pyrazinamidase, alpha-galactosidase, alpha-glucosidase, bêta-glucosidase, bêta-glucuronidase, bêta-mannosidase, hydrolyse de l'esculine, hydrolyse de la gélatine, hydrolyse de l'hippurate, production d'acétoïne, acide pyroglutamique arylamidase, pyrrolidonyl-arylamidase, uréase, acidification du L-arabinose, du D-arabitol, de la cyclodextrine, du mannitol, du mélibiose, du mélizitose, du méthyl-bêta-D-glucopyranoside, du pullulane, du raffinose, du ribose, du saccharose, du sorbitol, du tagatose et du D-xylose.
. La production de phosphatase alcaline est négative en galerie API rapid ID32 Strep et parfois faiblement positive en galerie API CORYNE. Une réponse variable est observée pour l'acidification du glycogène.
. En utilisant des galeries API rapid ID32 Strep les codes obtenus sont 4 0 0 1 6 6 0 1 0 0 0 ou 4 0 0 0 2 6 0 0 0 0 0 ou 4 0 0 1 6 6 0 1 0 0 0.
En utilisant des galeries API CORYNE les trois souches donnent les codes 0 5 2 0 1 6 2 ou 0 4 2 0 1 6 0 ou 0 5 2 0 1 6 0.

Les souches ont été cultivées à 37 °C dans une atmosphère contenant 5 p. cent de dioxyde de carbone. Les colonies obtenues sur gélose Columbia, enrichie de 5 p. cent de sang de mouton, sont circulaires, convexes, à contour régulier, grisâtres, non hémolytiques et leurs diamètres n'excèdent pas 0,5 mm après 48 heures d'incubation.

Actinomyces marimammalium doit être distingué de ¤ Arcanobacterium pluranimalium. En effet, ces deux espèces sont constituées de bacilles à Gram positif, aéro-anaérobies et elles peuvent être isolées de mammifères marins. Le diagnostic différentiel est toutefois aisé car ¤ Arcanobacterium pluranimalium est une espèce catalase positive, hydrolysant l'esculine, la gélatine et l'hippurate, ne produisant ni bêta-galactosidase ni bêta-galacturonidase et n'acidifiant pas le lactose.

Habitat et pouvoir pathogène

L'habitat et le pouvoir pathogène des souches de Actinomyces marimammalium sont encore inconnus.

La souche type a été isolée, en association avec d'autres bactéries (Escherichia coli, Streptococcus sp., Actinobacillus sp.), de divers organes (poumon, rate, foie, rein, nœud lymphatique) du cadavre d'un phoque à capuchon (Cystophara cristata) présentant des lésions de pneumonie.

Les deux autres souches proviennent soit de l'intestin grêle d'un phoque gris (Halichoerus grypus) victime d'un coup de fusil soit d'un poumon d'un marsouin (Phocoena phocoena) retrouvé mort.

Orientation bibliographique

Culture Collection, University of Göteborg, Sweden (CCUG).

HOYLES (L.), PASCUAL (C.), FALSEN (E.), FOSTER (G.), GRAINGER (J.M.) and COLLINS (M.D.): Actinomyces marimammalium sp. nov., from marine mammals. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2001, 51, 151-156.

STACKEBRANDT (E.) et GOEBEL (B.M.) : Taxonomic note: A place for DNA-DNA reassociation and 16S rRNA sequence analysis in the present species definition in bacteriology. Int. J. Syst. Bacteriol., 1994, 44, 846-849.

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